爭議公投被迫統一 巴布亞至少50萬人喪生
巴布亞原是荷蘭的殖民地，二戰結束巴布亞原於1961年宣布獨立，但被印尼強行佔領。隨後在1969年一場具高度爭議的公投後，巴布亞在1969年被正式併入印尼領土。
自印尼統治巴布亞後，印尼便大舉殺害異議人士。主張巴布亞自決獨立的「自由西巴布亞陣營」(The Free West Papua Campaign)指出：「在針對當地原住民的種族滅絕屠殺中，有超過50萬名平民喪生。有成千上萬名的居民遭到性侵、折磨、監禁或『被失踪』。言論自由等基本人權被剝奪，巴布亞人自此一直生活在恐懼之中。」
曾於1999年親身進入巴布亞採訪的美國政治學者弗爾切克(Andre Vltchek)表示，巴布亞及剛果於90年代時期發生的戰爭，可能是地球上最可怕的種族滅絕事件。
種族備受歧視、自然資源遭剝奪 巴布亞人自決聲浪不斷
自印尼統治巴布亞以來，當地獨立聲浪就未曾停歇，主要有以下幾個原因。
以種族來說，巴布亞人是美拉尼西亞人(Melanesia)的分支民族，儘管種族組成複雜，但與印尼最大種族爪哇人截然不同。
經濟方面，爪哇人佔主導地位，但巴布亞人的經濟發展較為落後，佔印尼全國總GDP僅約1.9%。雖然巴布亞盛產金、銅、木材和天然氣等，自然資源相當豐富，但巴布亞人卻抱怨，當地人並沒有從中獲得財富。
以地理位置分析，巴布亞離印尼傳統政經中心雅加達相對距離遙遠，雅加達自然以比較輕視的眼光看待這片邊陲土地。
此外，印尼政府各種直接或間接的政策，都讓巴布亞處於弱勢地位。不過，今年甫勝選連任的印尼總統佐科威(Joko Widodo)經常定期造訪巴布亞，並打算在此設立跨巴布亞高速公路等基礎建設，但對於先前印尼政府犯下的各種反人道暴行，批評人士認為，與其獲得新的道路建設，也許讓巴布亞人獲得應有的公平正義，還比較重要。
為何巴布亞不受關注？媒體被嚴禁控管、國際為利益漠視是主因
英國衛報(The Guardian)報導，自60年代起印尼掌控巴布亞以來，幾乎所有外國媒體、非政府組織和人道主義機構都被嚴禁進入巴布亞。
此外，在當地工作的巴布亞記者面臨更嚴重的威脅。報導指出，有數名記者在最近10年遭到殺害、逮捕、毆打或遭受酷刑，只因為他們報導了印尼政府在當地的活動。
殘忍的現實是，國際社會並不是沒有看見印尼在巴布亞的血腥鎮壓，但漠視讓他們有利可圖。
澳洲新聞網站「Greenleft」報導，國際礦業公司覬覦巴布亞豐富的礦產資源，並藉由印尼軍方的保護，在此安全營運。印尼為在巴布亞維持政權，需要購買大量武器，國際武器公司也從中獲得廣大的利益；另外，英國政府為印尼警力提供財政支援和培訓，他們同樣也是漠視巴布亞困境的幫凶。
國際漠視、澳洲態度成關鍵 專家：已非同日而語
針對現今巴布亞的情勢，流亡英國的西巴布亞獨立運動領袖文達(Benny Wenda)持續要求印尼政府，讓巴布亞人再次舉辦獨立公投，並且呼籲澳洲政府對目前巴布亞的人道危機發出公開聲明。這讓人不禁想起20年前，同樣主張舉辦獨立公投、並獲得澳洲支持，順利從印尼獨立成功的小國東帝汶。
澳洲特殊廣播服務公司新聞台(SBS News)報導指出，1999年8月，印尼軍方為反東帝汶的獨立公投結果，攻擊當地平民，至少有1,400人被殺。對此，澳洲迅速佈署一支由聯合國授權的部隊進行干預，最後才讓東帝汶獨立成功。
關鍵評論網指出，在當時印尼的反共政策下，西方國家原先紛紛默許當時印尼在東帝汶的非為，但隨冷戰結束，澳洲開始轉而呼籲印尼尊重人權，並轉向支持東帝汶獨立，當時的決策左右了東帝汶的情勢，讓東帝汶受到國際關注、進而有著自治的機會。
現今巴布亞同樣遭遇國際漠視，澳洲的態度再受關注。
不過，澳洲外交暨貿易部(DFAT)發言人已於2日表示，澳洲承認印尼對巴布亞省的領土主權。澳洲迪肯大學(Deakin University)東南亞安全事務專家金斯伯里(Damien Kingsbury)則說，由於澳洲跟印尼於2014年簽署「龍目島條約」(Lombok Treaty)加強雙邊關係、以及巴布亞被聯合國正式承認為印尼的一部分，澳洲不太可能對巴布亞進行干預，情況與東帝汶獨立時期不可同日而語。
今日印尼政府仍嚴控巴布亞、甚至封鎖當地網路，國際社會目前也無高度聲援的跡象，但雅加達郵報(The Jakarta Post)指出，印尼長期歧視巴布亞人，雙方衝突不無升高的可能；而唯有巴布亞人獲得應有的愛與平等對待，他們才會覺得，印尼是真正的家。